Raki, jeune garçon ayant vu toute sa famille se faire tuer par un yoma (être malfaisant dévorant les humains et capable de prendre l'apparence d'un humain), se fera sauver la vie par une femme du nom de Claire qui est une Claymore (mi humain mi yoma qui vivent à l'écart de la société et dont la mission est d'éradiquer les yoma).
Ces claymores qui ont les yeux argentés et qui deviennent dorés lorsque celles-ci utilisent leurs pouvoirs, sont craintes par les humains, mais Raki prit d'affection pour elle et d'interêt la suivra dans son voyage ...
